蒸汽發生器所產生的煙氣主要由燃燒過程中產生的煙霧與氣體構成。其中包含眾多有害物質，包括未完全燃燒的燃料及氧氣，以及燃燒過程中所生成的各類氣體，包括二氧化硫、氮氧化物、一氧化碳等。以下是蒸汽鍋爐煙氣治理的一些主要方法：

1.脫硫處理：脫硫是煙氣治理的一個關鍵環節，主要有鈣法、鎂法、鈉法、氨法以及有機堿法等。鈣法和鎂法通過投入石灰或者鎂，借由化學反應來吸收二氧化硫。鈉法則主要運用鈉鹽，在水中形成堿性環境以吸收二氧化硫。氨法則是利用氨氣在高溫下分解產生氨氣，隨後將吸收二氧化硫。有機堿法則是利用有機堿的堿性來吸收二氧化硫。

2.脫硝處理：當前的脫硝技術主要有低氮燃燒技術、SNCR脫硝技術、SCR脫硝技術、臭氧氧化脫硝技術等。其中，低氮燃燒技術是通過調控燃燒過程中的氮氧化物的產出，以減少其排放量。而SNCR脫硝技術，即通過將氨氣與二氧化碳噴入煙道，借由反應來清除氮氧化物。同時，也存在SCR脫硝技術，這是一種借助催化劑的力量，將氮氧化物還原成為氮氣與水的技術。還有臭氧氧化脫硝技術，這項技術是將氮氧化物分解為氮氣與氧氣的過程。

3.除塵處理：重力沉降式除塵器、旋風除塵器、衝擊式除塵器、離心式水膜除塵器等皆可用來去除煙氣中的顆粒狀物質。

4.通風方式：蒸汽鍋爐的三種主要排煙通風方式分別為負壓通風、平衡通風以及強製通風。其中，負壓通風需要聘用引風機來抵擋氣流阻力，但可能導致爐溫降低以及熱損失的增大。平衡通風則同時配置送風機與引風機，使得蒸汽鍋爐出口因保持負壓而提高了安全性與衛生條件。強製通風則通過直接使用風扇將煙氣排出爐外，此方式尤適用於規模較小的蒸汽鍋爐。

另外，部分蒸汽鍋爐已采用冷凝技術，通過將排煙溫度降低至50~70℃，來回收煙氣中的顯熱與凝結潛熱。這樣一來，熱效率可達109%，從而有效減小對環境的衝擊。